铁路工程甲级监理公司在问题发现和整改方面，通常会采取以下步骤：

1. 巡查和检查：监理公司会定期进行巡查和检查，对施工现场进行全面的观察和评估。他们会密切留意可能存在的问题和隐患，并记录下来。

2. 问题记录和报告：一旦问题被发现，监理公司会将其记录下来，并及时向相关责任方进行问题报告。这包括施工单位、建设单位、监管部门等。问题报告中会包含问题的描述、位置、影响、分类等信息。

3. 问题分析和评估：监理公司会对发现的问题进行深入分析和评估。他们会确定问题的原因和根源，并评估问题的严重程度和影响范围。这有助于确定采取适当的整改措施。

4. 整改措施的制定和实施：监理公司会制定整改措施，并确定负责执行的责任方。整改措施应根据问题的性质和严重程度进行具体的制定，确保问题得到有效解决和防止再次发生。

5. 监督和检查：监理公司会对整改措施的执行进行监督和检查。他们会跟踪整改进展情况，检查整改措施的有效性和执行情况，并在需要时提出建议和要求。

6. 问题闭环和反馈：一旦问题得到解决，监理公司会进行问题闭环和反馈。他们会确保问题被完全解决，并向相关责任方提供整改结果的反馈和汇报。

通过以上措施，铁路工程甲级监理公司能够及时发现施工现场的问题，采取适当的整改措施，确保问题得到及时解决。这有助于维护施工工程的安全和质量，确保项目按照规定和计划进行，并提高监理公司的专业声誉和客户满意度。同时，监理公司还应持续改进问题发现和整改的流程和方法，适应不同项目的需求和特点。